一、定义不同
1、洁净室是指将一定空间范围内之空气中的微粒子、有害空气、细菌等之污染物排除，并将室内之温度、洁净度、室内压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内，而所给予特别设计之房间。亦即是不论外在之空气条件如何变化，其室内均能俱有维持原先所设定要求之洁净度、温湿度及压力等性能之特性。洁净室最主要之作用在于控制产品所接触之大气的洁净度日及温湿度，使产品能在一个良好之环境空间中生产、制造，这样的一个空间我们一净称之为洁净室；
2、洁净棚又名洁净工作棚（无尘棚、净化棚、操作工作台等），是指在洁净室内用防静电网格帘或有机玻璃围一个小空间，上方采用HEPA及FFU送风单元组成一相对洁净室较高净化级别的空间，洁净棚可配风淋室、传递窗等净化设备；
二、材料比较
1、洁净室一般采用泡沫彩钢或是岩棉板吊顶有立墙，有独立的空调送风系统，空气经过初中高效三级过滤，人员及物料配有风淋室及传递窗洁净过滤。三、.洁净棚净化级别的选择：
2、洁净棚框架一般可分为三种：不锈钢方通、烤漆铁方通以及工业铝型材，顶部及可用不锈钢钢板、烤漆冷塑钢板、防静电网格帘及压克力有机玻璃等材料。周围一般都是采用防静电网格帘或是有机玻璃，送风部用均采用FFU洁净送风单元。
三、洁净棚净化级别的选择：
比较多的客户，会选用千级洁净棚，或万级洁净棚，少量客户会选用百级或万级。总之，洁净棚级别的选择在于客户对洁净度的需要而定，但因洁净棚比较密闭，如选择洁净棚级别比较低时，往往会带来部分副作用：冷量不足，员工在洁净棚内会感觉比较闷热。
四、洁净棚与无尘车间的成本比较：
1、洁净棚通常都是建在洁净室内，所以不需要考虑风淋室、传递窗以及空调送风系统，成本与洁净室比较会大大降低，当然这与洁净棚所需材料、大小以及洁净级别有一定的关系。会将洁净棚建在无尘室之内，但有的客户不想单独建无尘车间，在洁净棚不考虑空调系统及风淋室、传递窗等净化设备的情况下，洁净棚的成本约是无尘车间造价的40%~60%，这取决于客户对洁净棚材料的选择，以及洁净棚的大小。需要洁净的区域越大，洁净棚与无尘车间的成本相比差别会越小。
五、利弊
1、A）洁净室施工慢，成本较高；
B）洁净室通常高度在2600MM左右，工作人员在里面工作不会感到压抑。
2、A）洁净棚施工快、成本低、方便拆装、可重复使用；
B）由于洁净棚通常高度在2米左右，如果使用大量FFU会让洁净棚内部噪音大；
C）由于没有独立的空调送风系统，洁净棚内部往往会感觉到闷热；
D）洁净棚如果不建在洁净室内，因缺少中效空气过滤器的过滤，高效过滤器相对洁净室寿命会缩短，这样频繁的更换高效过滤器会使成本增加。
